rpg_windows.js 파일의  Window_ItemList 쪽을 보면 

Window_Selectable.prototype.initialize.call(this, x, y, width, height); 부분이 있는데 괄호 안을 원하시는 수치로 바꾸세요. 

각 x, y 좌표와 가로 세로값. 예)(this, 50, 80, 400, 400)

그리고 그 밑에있는 아래와 같은 부분의 숫자도 바꿔주시면 됩니다. 아이템 리스트를 가로 몇줄로 보여줄건지.

Window_ItemList.prototype.maxCols = function() {

    return 2;

};

일단 돌아가는데는 문제가 없는데 저도 잘 몰라서 다 건드려보면서 찾은거라 어떨지 모르겠네요.