별 다른 관계는 없는 걸로 알아요.
같은 이름을 쓰거나 순서가 꼬이지 않는 이상은 여러 개 쓸 수 있는 것 같아요. 아직 실험은 안 해봤지만..

메세지창 배경을 바꿔주는 플러그인이라면 가장 유명한 Yanfly 엔진이 있겠지요. Galv 님 플러그인 중에도 메세지창을 바꿀 수 있는 게 있는 걸로 압니다.