검색을 습관화합시다.

[ 스크립트 페이지 추가 ]

Font.default_name = '폰트이름'
Font.default_size = 18 #폰트크기

이거로 되는거로 알고있습니다.

스크립트의 Scene_Base 말고,
맨밑의 Main에 코드를 집어넣어보세요.
단,
rgss_main { SceneManager.run }
보다 윗줄에 넣어야합니다.

참고로 저 같은 경우는 새 프로젝트 작성하면,
Main에 폰트 디폴트 설정이 되어있거든요.
질문자님께서도 저와 같은 경우가 아닐까 추측해봅니다.

스크립트에 따라서는(특히 메세지 스크립트) 자체적으로 사용할 폰트를 지정하는 것도 있습니다. 스크립트 편집기에서 스크립트 목록에 대로 오른쪽 클릭->찾기로 폰트 관련 부분을 찾아보면 어떤 것이 기본폰트 설정에 손대고 있는지 알 수 있을 겁니다.