제가 아는겐 RPG VX ACE 프로그램에서 바꾸지 않고 게임을 실행하고 그 게임에서
F1키를 누르면 게임설정이 나오는데 거기서 키를 바꾸면 됩니다.

< 기본 버튼/키 설정 - 바꾸려면 F1 키 >
결정(C버튼) - 엔터 , 스페이스 , Z
취소(B버튼) - ESC , X , Num0

기본적으로도 결정 Z 에 취소 X 가 되어있습니다.

스크립트 에디터를 열어서
[Input Ex - 전체키 입력 확장] 스크립트중 186줄 부근을 보면 아래와 같은 내용을 볼 수 있습니다.

:B => [Esc, Pad0],
:C => [Enter, Space],

위 내용을
:B => [Esc, Pad0, X],
:C => [Enter, Space, Z],

이와같이 바꿔주시면 기존 Z, X 키를 사용할 수 있게 됩니다.